Mục tiêu của quy hoạch là đáp ứng nhu cầu phát triển kinh tế-xã hội, đảm bảo an ninh quốc phòng và phục vụ các sự kiện quốc tế quan trọng như Tuần lễ Cấp cao APEC 2027.
Trong giai đoạn 2021-2030, sân bay Phú Quốc dự kiến nâng công suất lên 10 triệu hành khách và 25.000 tấn hàng hóa mỗi năm. Để đạt được mục tiêu này, sẽ cải tạo và nâng cấp đường cất hạ cánh hiện hữu, kéo dài lên 3.300m x 45m khi cần thiết. Đồng thời, quy hoạch xây dựng thêm đường cất hạ cánh thứ hai với cùng kích thước, cách đường cất hạ cánh hiện tại khoảng 360m về phía Bắc.
Về cơ sở hạ tầng nhà ga, nhà ga hành khách T1 hiện tại với công suất 4 triệu hành khách/năm sẽ tiếp tục phục vụ cả chuyến bay nội địa và quốc tế. Dự kiến xây dựng thêm nhà ga T2 ở phía Đông nhà ga T1, công suất 6 triệu hành khách/năm, với quỹ đất dự trữ cho khả năng mở rộng khi cần.

Ngoài ra, một nhà khách VIP sẽ được xây dựng phía Đông đài kiểm soát không lưu để phục vụ Tuần lễ Cấp cao APEC 2027; sau sự kiện, nhà khách này sẽ chuyển đổi phục vụ các chuyến bay quốc tế hoặc hàng không chung.
Tầm nhìn đến năm 2050, sân bay Phú Quốc đặt mục tiêu nâng công suất lên 18 triệu hành khách và 50.000 tấn hàng hóa mỗi năm. Nhà ga T1 sẽ tiếp tục phục vụ 4 triệu hành khách/năm cho các chuyến bay nội địa. Nhà ga T2 sẽ được mở rộng để đạt công suất 8 triệu hành khách/năm, cũng dành cho các chuyến bay nội địa. Thêm vào đó, một nhà ga T3 sẽ được xây dựng phía Tây nhà ga T1, công suất 6 triệu hành khách/năm, chuyên phục vụ các chuyến bay quốc tế.
Tổng diện tích đất sử dụng cho giai đoạn 2021-2030 là 865,93 ha, trong đó 851,67 ha là diện tích hiện có và 14,26 ha dự kiến bổ sung. Diện tích này sẽ được duy trì đến năm 2050.
Lãnh đạo Cục Hàng không Việt Nam nhấn mạnh rằng việc lập quy hoạch này là cần thiết để đồng bộ với quy hoạch tổng thể phát triển hệ thống cảng hàng không, sân bay toàn quốc, cũng như quy hoạch của tỉnh Kiên Giang.
Điều này nhằm đáp ứng yêu cầu phát triển kinh tế-xã hội, đảm bảo an ninh quốc phòng và tăng trưởng của ngành hàng không, đồng thời tạo cơ sở triển khai các hạng mục công trình phục vụ Tuần lễ Cấp cao APEC 2027.