Đi vào cụ thể các điều luật, một số ý kiến đề nghị dự thảo Luật Doanh nghiệp sửa đổi nên bỏ chương nói về Doanh nghiệp nhà nước vì quy định về vấn đề này đã có ở các luật khác, đồng thời tránh sự phân biệt đối xử, đảm bảo tính bình đẳng, tự do cạnh tranh giữa các loại hình doanh nghiệp. Cần có quy định cho doanh nghiệp nhà nước nhưng phải một luật khác chứ không phải bằng một chương của Luật Doanh nghiệp. Ông Hoa Đình Thanh, Phó giám đốc Hành chính - Tổng công ty Bến Thành nói: "Chúng tôi thấy có chương doanh nghiệp ở đây thì về mặt khoa học pháp lý là một bước lùi. Thứ 2 là vấn đề bình đẳng, vì trước đây khi thực hiện Luật doanh nghiệp thì chúng ta có nói với nhà đầu tư nước ngoài chuyển sang thành lập công ty trách nhiệm hữu hạn theo một luật chơi. Bây giờ nếu đưa vô đây thì đúng là không nên".
Đặc biệt, một trong những vấn đề phiền hà đối với doanh nghiệp là yêu cầu điều kiện kinh doanh đối với ngành nghề kinh doanh có điều kiện. Tại thời điểm này, đối với một số ngành nghề kinh doanh có điều kiện, Luật Doanh nghiệp yêu cầu phải có một số điều kiện kinh doanh như bản sao chứng chỉ hành nghề của người quản lý và xác nhận về vốn pháp định tại thời điểm đăng ký thành lập doanh nghiệp. Đặc biệt cách thức và yêu cầu đăng ký kinh doanh theo mã ngành kinh tế quốc dân là chưa hợp lý, chưa đảm bảo nguyên tắc “doanh nghiệp được quyền kinh doanh tất cả các ngành nghề mà pháp luật không cấm, hoặc không hạn chế”. Hiện nay cứ thêm ngành nghề là phải đăng ký lại, rất phức tạp.

Bà Nguyễn Thị Khánh, Phó chủ tịch thường trực Hiệp hội Du lịch TPHCM thì đồng tình với quy định về điều kiện kinh doanh nhưng phải xác định thời gian rõ ràng. Nếu sau thời gian đăng ký mà doanh nghiệp không thực hiện thì xóa hạng mục ngành nghề đã đăng ký. Điều này nhằm tránh trường hợp nhiều doanh nghiệp trong ngành du lịch kinh doanh lữ hành nhưng không có đăng ký. Bà Khánh nói: "Lâu lâu xuất hiện những doanh nghiệp vi phạm không bổ sung điều kiện kinh doanh mà vẫn kinh doanh lữ hành nội địa, lữ hành quốc tế. Tôi thấy cần bổ sung thời gian thực hiện điều kiện kinh doanh".
Ông Trần Du Lịch, Phó trưởng Đoàn đại biểu Quốc hội Thành phố cho biết, về vấn đề đăng ký kinh doanh, trong các cuộc họp trước đây với Ủy ban Kinh tế Quốc hội còn có 2 luồng ý kiến khác nhau. Ông Trần Du Lịch nói: "Qua thảo luận cần làm rõ thế nào là ngành nghề cấm và ngành nghề kinh doanh có điều kiện. Hiện nay, Bộ Kế hoạch Đầu tư đang tổng hợp và sẽ trình những danh mục ngành nghề cấm và ngành nghề kinh doanh có điều kiện. Ngoài cái đó ra giấy đăng ký kinh doanh không ghi gì cả".
Theo kế hoạch dự thảo Luật Doanh nghiệp sửa đổi sẽ được thảo luận tại kỳ họp của Quốc hội vào cuối tháng này.
